日本自然エネルギー株式会社（にっぽんしぜんエネルギー、英文社名："Japan Natural Energy Company Limited"）は、東京都品川区大崎に本社を置く自然エネルギーの導入促進会社である。風力発電、バイオマス発電、水力発電の推進事業を主とし、「グリーン電力証書」を発行して自然エネルギー価値基準を創造している。

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