『コミック百合姫S』（コミックゆりひめエス）は一迅社発行の女性同士の恋愛（百合）を題材にした漫画雑誌。『コミック百合姫』の姉妹誌として2007年6月に創刊された。発売日は3月、6月、9月、12月の18日。『コミック百合姫』同様「男子禁制？」を標榜しているが、萌え系4コマやメディアミックス系などの男性向け雑誌で活躍中の作家による作品の連載が多く、「百合姫」と比べてやや男性読者向けに振られた構成となっている。読者層について、2008年7月現在の最新号におけるアンケートはがきの回答から、『コミック百合姫』の男女比が男性27%、女性73%と女性が占める割合が多いのに対して、『コミック百合姫S』は男性62%、女性38%と男性の比率がやや高い。2010年9月18日発売のvol.14をもって廃刊し、隔月刊行となる『コミック百合姫』と統合された。統合の理由について、編集長の中村成太郎は「当初、コア層向けの『百合姫』とライト層向けの『百合姫S』とで棲み分けを図っていたが、『百合姫S』の読者が『百合姫』に移ってくる傾向が目立ち、分ける意味がなくなったため」と説明している。2010年のコミック百合姫との統合による、連載の移籍先は以下の通り。

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