京都市立藤森中学校（きょうとしりつふじのもりちゅうがっこう）は、京都市伏見区にある公立中学校。1948年に創立。旧陸軍第16師団の兵舎跡を利用して、中学校とした。当時の師団本部は聖母女学院となった。陸軍の演習地を利用したため、その広大なグラウンドは400メートルトラックが2つ確保できるほどであった。後にその敷地の半分は京都市青少年科学センター・京エコロジーセンターとなり、現在の敷地は創設時の半分となっている。なお、本校の位置する伏見区深草池ノ内町は、同じ京都市立中学校である京都市立深草中学校の学区である。このためこの学校は校区外に設置されている。京都市伏見区深草池ノ内町55番地

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