藤井 茂太（ふじい しげた、万延元年9月21日（1860年11月3日） - 昭和20年（1945年）1月14日）は、日本陸軍の軍人。最終階級は陸軍中将。福本藩公用人・藤井義柄の次男として生まれる。外国語学校、陸軍幼年学校を経て、明治13年（1880年）12月、陸軍士官学校（旧3期）を卒業。野砲第2大隊付などを経て、明治18年（1885年）12月、陸軍大学校（1期）を卒業。参謀本部第2局員、清国出張、陸大教官、ドイツ留学、兵站総監部付などを歴任し、第2軍参謀（後方主任）として日清戦争に出征。陸大教官、オーストリア公使館付、陸大教官兼教頭、陸大幹事を経て、明治35年（1902年）6月、陸軍少将に進級、陸大校長を務めた。日露戦争では、第1軍参謀長として出征し、司令官の黒木為楨を補佐した。以後、陸軍砲工学校長、東京湾要塞司令官などを歴任。明治42年（1909年）8月、陸軍中将に進み、野戦砲兵監、第12師団長などを務め、大正3年（1914年）8月、予備役に編入された。

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