本項では、フジテレビにて関東ローカルで毎週火曜-土曜未明（平日深夜）に放送の深夜アニメ番組に関して取り上げる。2016年3月現在、金曜未明（木曜深夜）に放送中の『ノイタミナ』枠、およびかつて木曜未明（水曜）深夜に放送されていた『NOISE』枠作品に関しては該当項を参照。特記無き限りは30分番組。

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