マロニルCoA (マロニルコエンゼイムエー、マロニルコエー)は、マロニル補酵素Aの略であり、化学式 CHNOPSで表される分子量 853.58の化合物である。補酵素Aの末端のチオール基がマロン酸とチオエステル結合した化合物で、脂肪酸やポリケチドの合成において重要な役割を担っている。生体内ではアセチルCoAカルボキシレース (ACC) によりアセチルCoAから生合成される。

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