第46師団（だいよんじゅうろくしだん）は、大日本帝国陸軍の師団の一つ。1943年（昭和18年）5月、本土防衛強化のため第42師団、第43師団、第46師団、第47師団の新設が命じられた。第46師団は、5月14日に留守第6師団と独立第66歩兵団を基幹に熊本で編成され、西部軍に属した。1943年10月に南方への転出が命ぜられ、所属の歩兵第123連隊がジャワ島東部の小スンダ列島スンバワ島に上陸し、二ヶ月後には歩兵第147連隊がスンバワ島に上陸した。残りの歩兵第145連隊は、輸送船の関係で進出することができず、1944年（昭和19年）6月、硫黄島の小笠原兵団に配属され硫黄島の戦いに参戦し全滅した。師団主力は、1945年（昭和20年）4月、スンバワ島からマレー半島警備に転用されたが、大きな戦闘を交えることもなく終戦を迎えた。

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