UEFAカップ 2008-09は、第38回目のUEFAカップである。決勝はトルコのイスタンブールで2009年5月20日に行われ、シャフタール・ドネツクがウクライナ勢として初めて優勝を飾った。2009-10シーズンより大会名がUEFAヨーロッパリーグに改名されるため、この大会がUEFAカップの名で開催される最後の大会となった。得点王は11得点を上げた、CSKAモスクワのヴァグネル・ラヴ。組み合わせ抽選会は1回戦が7月1日、2回戦が8月1日、いずれもスイス、ニヨンで行われた。第1戦は7月17日。第2戦は7月29・31日に実施。予選1回戦を勝ち抜いた37チームと、予選2回戦からのシード権を持つ16チーム、インタートト・カップを勝ち上がった11チーム、計64チームがホーム＆アウェーで勝敗を決する。第1戦が8月14日、第2戦が8月26・28日に行われた。グループステージを勝ち抜いた24チームと、チャンピオンズリーグのグループステージで各組3位となった8チームがノックアウト方式のトーナメントで争う。準決勝まではH&A、決勝のみ中立地での一発勝負第1戦が2009年2月18日と19日、第2戦が2月26日に実施。ラウンド16進出決定のクラブを太字で表示する。チーム #1 に記載されたクラブが第1戦のホームゲームになる。第1戦が2009年3月12日、第2戦が3月18日、19日に実施。準々決勝進出決定のクラブを太字で表示する。第1戦が2009年4月9日、第2戦が4月16日に実施。準々決勝進出決定のクラブを太字で表示する。第1戦が2009年4月30日、第2戦が5月7日に実施。準々決勝進出決定のクラブを太字で表示する。

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