水素細菌（すいそさいきん）とは、土壌細菌の一種。遊離の水素を酸化し、その反応によって生じるエネルギーを利用して、炭酸同化を行う化学合成細菌。有機栄養物を利用して従属栄養生活も行うが、この方法で発育したある種類では、水素利用の能力が減退するか、または失われる。

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