ファンタシースターオンラインのエネミー一覧（ファンタシースターオンラインのエネミーいちらん）では、ファンタシースターオンラインに登場するモンスターについて述べる。プレイヤーに襲い掛かってくるモンスターを、ゲーム内ではエネミーと呼称する。エネミーは主に4つの分類に分けられている。エピソード1では1つのエリアは1つの種族で統一されていたが、エピソード2では1つのエリアに様々な種族のエネミーが混在している。なお、アルティメットの難易度ではそれぞれ姿や名前が新しいものになる（変わらないものもいる）。名前の後ろの（）内はアルティメットモードでの名称。名称の後にレアと付記されているものは500分の1の確率で登場するレアエネミーを指す。なお、オフラインモードとオンラインモードの区別がある作品では、オンラインモードの方がエネミーのパラメータが強化されており、取得経験値も高くなっている（PSOBBでは1人用モードがオフラインモードに相当する）。パイオニア1が到着するよりも前から惑星ラグオルに存在していた生物。元は大人しく、パイオニア1の人々に襲い掛かるような事も無かったが、ブルーバーストの少し前から何らかの外的要因によって凶暴化し始めたらしい。何らかの後天的な要因によって異形へと進化を遂げた生物群。ほとんどが健全な生態系から逸脱し、常識では考えられない生物である。人の手によって作られた非生命体。作業用等のロボットが改造されたものと、最初から戦闘用に作られたものと2種類ある。人間とは違う第三者の意思と操作によってプレイヤーに襲い掛かってくる。アルティメットモードではほとんどのエネミーが仰け反りを起こさない。「遺跡」の中で確認された、未知の存在。あらゆる点で生物の常識を大きく外れており、生物であるかどうかすら疑わしい存在。唯一共通しているのは、D型と呼ばれる細胞を持っている事だけである。

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