マリア・アンナ・フォン・バイエルン（Maria Anna von Bayern, 1574年12月8日 - 1616年3月8日）は、神聖ローマ皇帝フェルディナント2世の最初の妃。フェルディナントの帝位継承以前に亡くなったため、神聖ローマ皇后とならなかった。バイエルン公ヴィルヘルム5世とレナータ・フォン・ロートリンゲンの娘としてミュンヘンで生まれた。1600年4月、グラーツのでフェルディナントと結婚。7子をもうけた。

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