シスタチオニン（Cystathionine）は、システイン合成の中間体である。ホモシステインとセリンより、シスタチオニンβ-シンターゼの触媒によって作られる。また、シスタチオニンγ-リアーゼによって、システインとα-ケト酪酸に分解される。尿中に過剰に排出されると、シスタチオニン尿症と呼ばれる。

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