本因坊策元（ほんいんぼう さくげん、延宝3年（1675年） - 元禄12年（1699年）は江戸時代の囲碁棋士。江戸生まれ、本姓は佐山、上手。本因坊道策跡目で、道策五弟子の一人と数えられる。法名は日雲。本因坊道策の跡目道的の死後の元禄5年（1692年）、18歳五段で道策の再跡目となる。この時に兄弟子の桑原道節は争碁を望んだとされるが、道節は井上家を継ぐ。策元はこの年から御城碁に出仕して扶持を得るようになり、毎年出仕して7局を務めて6勝1敗の戦績を残す。元禄12年（1699年）に25歳で没す。跡目を二人続けて失った道策は、その後は跡目を定めることはなく、神谷道知の成長に期待をかけた。　御城碁では、初年には安井知哲に先番13目勝。元禄9年、井上道節因碩に先番5目勝。元禄10年、4世安井仙角（定先）に白番11目勝などがある。

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