『デジモンクロニクル』とは株式会社バンダイから発売された携帯ゲーム機『デジモンペンデュラムX』（以下ペンデュラムX）シリーズのバックグラウンドストーリーである。ペンデュラムXのversionごとに、それぞれ章名と副題が付けられており、以下に記述する。おおまかな流れとしてVer1.0はVer1.5へと続き、同時進行でVer2.0、そしてVer3.0へと収束していく。なお、TVSP『DIGITAL MONSTER X-evolution』はこのデジモンクロニクルを基にストーリーを構成している。成長、進化を繰り返す事でその容量を肥大化させていったデジモン達は、『デジタルワールド』自身の容量を超えようとしており、それによりデジタルワールドは崩壊の危機に瀕していた。その最悪の事態を回避するため、デジタルワールドを管理するホストコンピューター『イグドラシル』は、『プロジェクト・アーク（箱舟計画）』を計画。その内容はイグドラシルのセキュリティの要である『ロイヤルナイツ』と、研究対象となるデジモンのみを新デジタルワールドへ転送、他のデジモン達を『Xプログラム』によって強制削除するというものだった。こうして、選ばれたデジモンは新たな世界で新たな進化をはじめ、不要なデジモンは削除されていくはずだった……。しかし、デジモンの生存本能は凄まじかった。Xプログラムを取り込み『X抗体』を作り出し、『X‐進化・ゼヴォリューション』する事により生き延びたのである。だが、X抗体と言えど長くXプログラムの脅威にさらされるのは危険であり、また旧デジタルワールドは更なる強き抗体を求め、奪い合う、これまで以上に弱肉強食の世界となる。そうして生き残ったデジモン達はXプログラムの脅威の無い新デジタルワールドへと逃げ込んでいった。しかしイクドラシルはそれを異分子とし、ロイヤルナイツによるXデジモンの殲滅が発令された。デジモンクロニクルをベースとしているのはブースター第20弾から第23弾、スターター9と10、およびアルティメットバトルセット『X進化デック』まで。以下はクロニクルの世界観を説明したカード。イグドラシルXプログラムX抗体ゼヴォリューションデクスリューションブラストエヴォリューションNEWデジタルワールド

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