長崎鉄道事業部（ながさきてつどうじぎょうぶ）とは、長崎県長崎市の長崎駅構内にある九州旅客鉄道（JR九州）の事業部の一つであり、長崎支社の管轄。※管轄境界駅については、長崎鉄道事業部が管理を担当する停車場を記載している。長崎鉄道事業部長崎車両センター（ながさきてつどうじぎょうぶながさきしゃりょうセンター）は、かつて長崎県長崎市に存在した九州旅客鉄道（JR九州）長崎支社長崎鉄道事業部管轄の車両基地である。長崎駅に隣接している。平成26年3月15日に九州新幹線西九州ルート開業に伴う高架事業により、車両基地を佐世保車両センターに移転した が、車両の留置や洗浄などは当分の間当センターでも実施される。長崎県長崎市尾上町1-89「崎サキ」…長崎支社を意味する「崎」と、長崎を意味する「サキ」から構成される。鉄道省時代は門司鉄道局、国鉄時代は門司鉄道管理局の管轄であったことから門司の「門」をとり「門サキ」と標記されていた。長崎鉄道事業部佐世保車両センター（ながさきてつどうじぎょうぶさせぼしゃりょうセンター）は、長崎県佐世保市にある九州旅客鉄道（JR九州）長崎支社長崎鉄道事業部管轄の車両基地である。早岐駅に隣接している。前述のとおり、2014年3月15日に長崎車両センターから基地機能が移管された。長崎県佐世保市早岐1丁目「崎サキ」…長崎支社を意味する「崎」と、長崎を意味する「サキ」から構成される。以下は、2016年4月1日現在の所属車両である。長崎鉄道事業部長崎乗務センター（ながさきてつどうじぎょうむセンター）は、長崎県長崎市の長崎本線長崎駅付近にある、九州旅客鉄道（JR九州）長崎支社長崎鉄道事業部管轄の運転士・車掌の乗務員基地である。長崎鉄道事業部佐世保運輸センター（ながさきてつどうじぎょうぶさせぼうんゆセンター）は、長崎県佐世保市の早岐駅構内にある、九州旅客鉄道（JR九州）長崎支社長崎鉄道事業部管轄の乗務員基地である。

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