クロロフレクサス門（Chloroflexi、クロロフレクスス門）は真正細菌の門である。カール・ウーズが光合成性の緑色非硫黄細菌を含む系統群として定義したのが始まりだが、光合成細菌は1目のみであり、非光合成の好熱菌や放線菌様の細菌も含んでいる。形態や特徴で定義するのは困難であるため、16S rRNA系統解析などに基づいて定義されている。綱の数としては6を含み、プロテオバクテリア門やフィルミクテス門など大型の門と並ぶ。タイプである"Chloroflexus"は、Χλωρός（クローロス/希: 緑色） + flexus（フレクスス/羅: 曲がった）を語源とする。ラテン語読みでクロロフレクスス門とも呼ばれる。クロロフレクサス門に属する細菌はリポ多糖(LPS)を含む外膜を持たず、ペプチドグリカン壁もないか、変わった組成になっている。これまでのところグラム陰性で糸状の群体を形成するものが多いが、約1/3がグラム陽性菌で、好熱菌や気菌糸と胞子を形成する放線菌様の種も含んでいる。2009年以降、姉妹群と想定される藍藻類と共にグラム陽性菌の系統に含まれるとする仮説が出ている。緑色非硫黄細菌を含む系統群であるが、他にも非光合成性の様々な細菌が含まれている。これまでに以下に示す6つの系統が存在していることが知られている。またそれぞれの系統には未培養の細菌が存在しており、それらはここに記した系統の説明にあてはまらない性質を持っている可能性もある。糸状の群体を形成し滑走により運動する細菌からなる系統。緑色非硫黄細菌と、それによく似た非光合成性の細菌が含まれている。高度好熱性で、偏性好気性の桿菌からなる系統。運動能はない。"Sphaerobacter"は一時は放線菌に近縁と考えられたことがあり、また"Thermomicrobium"に独自の門をあてる見解もある。しかしこの2つは系統的に近縁であることからクロロフレクサス門に含めて考えられるようになっている。偏性嫌気性で、糸状の群体を形成する細菌からなる系統。滑走能はない。排水処理施設の嫌気性汚泥から分離される。好熱性で滑走能のない糸状の群体を形成する細菌を含む系統。菌糸や胞子形成などの特徴を持つ。微好気、従属栄養。テトラクロロエチレンを分解する脱塩素細菌"Dehalococcoides ethenogenes"（未記載）を含む系統。なお、2009年に近縁の"Dehalogenimonas lykanthroporepellens"、"Dehalogenimonas lykanthroporepellens"、2013年には"Dehalogenimonas alkenigignens"、"Dehalococcoides mccartyi"が記載された。主として海洋から得られる系統で、その正体は現在のところ全く不明。

出典:wikipedia