宮古島警察署（みやこじまけいさつしょ）は、沖縄県警察が管轄する警察署のひとつである。沖縄県宮古島市平良字西里に庁舎を置き、宮古列島全域を管轄する。元々「宮古警察署」という名称であったが、2005年（平成17年）に平良市・城辺町・上野村・下地町・伊良部町の5市町村が合併して「宮古島市」となったことに伴い現在の名称となる。なお、旧名称の宮古警察署は岩手県宮古市に存在する。庁舎は、かつては旧平良市の中心部にあったが、2000年（平成12年）に現在地へ移転。

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