霊雲寺（れいうんじ）は、東京都文京区湯島にある真言宗霊雲寺派総本山の寺院。山号は宝林山。院号は大悲心院。本尊は胎蔵界・金剛界大日如来。元禄4年（1691年）、浄厳律師覚彦により創建された寺である。浄厳は寛永16年（1639年）、河内の生まれ。10歳の時、高野山で得度し、後に河内の教興寺（飛鳥時代、秦河勝の開基と伝える。大阪府八尾市）、延命寺（空海の開基と伝える。大阪府河内長野市）などを再興した。浄厳は柳沢吉保の帰依を受け、時の江戸幕府将軍徳川綱吉から現寺地を得て、霊雲寺を開創した。元禄6年（1693年）には多摩郡上図師村（東京都町田市）に百石の寺領を得、元禄7年（1694年）には関八州の真言律宗の総本寺とされた。江戸幕府から朱印状を受けるなど幕府の保護を受け、関東における真言律宗の中心的な寺院であった。関東大震災、第二次世界大戦の戦災で堂宇を焼失し、現在の堂宇は戦後復興されたものである。昭和22年（1947年）に真言宗霊雲寺派を公称して真言律宗から独立した。鉄筋コンクリート造2階建ての大本堂（灌頂堂）は、総門、庫裏とともに昭和51年（1976年）に落成したものである。大本堂は正面階段を上がった2階部分に仏壇を構え、両部（金剛界・胎蔵界）の大日如来像2躯を本尊として安置する。1階には寺務所、書院などがある。以上の重要文化財指定絵画は東京国立博物館に寄託されている。

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