第64回東京箱根間往復大学駅伝競走（だい64かいとうきょうはこねかんおうふくだいがくえきでんきょうそう）とは、1988年1月2日から1月3日までに開催された第64回目の東京箱根間往復大学駅伝競走である。前回大会上位9位までのシード校と予選会を勝ち上がった山梨学院大学、駒澤大学、明治大学、東洋大学、国士舘大学、東京農業大学の計15校が出場した。2連覇中の順天堂大学が往路で2位に6分9秒差をつけて優勝、復路でも復路2位の日本体育大学に11分近くの差をつける快走を見せて総合2位大東文化大学に17分09秒の大差をつけて3連覇を達成した。区間賞獲得7名（復路5人は全員区間賞）、残り3名も区間2位の走りを見せた。

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