第16軍（だいじゅうろくぐん）は、大日本帝国陸軍の軍の一つ。1941年11月5日に編制され南方軍に編入、ジャワ攻略戦に投入され短期間で占領を果たし、以後、軍政を担当。1944年3月27日、第7方面軍に編入。終戦をジャカルタで迎えた。

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