小千谷陣屋（おぢやじんや）は、新潟県小千谷市元町にあった陣屋。江戸時代初期には元町（川岸町）の信濃川の近くにあったが、大洪水のため川岸が流され、現在「介護老人保護施設水仙の家」がある所へ移転した。その頃、小千谷は天領だったため、陣屋は大きくなり、代官屋敷など多くの建物が建てられた。宝暦13年には小千谷組・塩沢組・六日町組・浦佐組・小出島組を支配範囲にしていた。

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