2008-09年シーズンのFリーグは、リーグ戦が同年7月12日に開幕、翌年2月8日に日程を終了した。リーグの優勝クラブは名古屋オーシャンズであった。2008-09年シーズンのFリーグのクラブは以下の通りである。各チーム3回戦総当り方式が採用された。この年も完全ホーム・アンド・アウェー・アンド・セントラル開催（各7節ずつ）が行われた。セントラル開催（リーグ主管の全チーム集結戦）は渋谷区の国立代々木競技場第1体育館で3節（第1・8・9節。うち第8・9節は2日間連続）、広島市の広島グリーンアリーナで第16・17節を2日間連続開催、札幌市の真駒内セキスイハイムアイスアリーナ（第12節）と富山市の富山市総合体育館（第14節）で1節ずつの合計7節が割り当てられた。勝ち点制度で争われ勝ちが3点、引分が1点、負けは0点。

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