スーパーサイエンスハイスクールとは文部科学省が科学技術や理科・数学教育を重点的に行う高校を指定する制度のことである。SSHと略記される。2002年（平成14年）度に構造改革特別要求として約7億円の予算が配分され、開始された。2007年（平成19年）度予算では約14億4443万円、2010年（平成22年）度予算では約20億6500万円、2011年（平成23年）度予算では約24億400万円が配分されており、増額傾向にある。目的は「高等学校及び中高一貫教育校における理科・数学に重点を置いたカリキュラムの開発、大学や研究機関等との効果的な連携方策についての研究を推進し、将来有為な科学技術系人材の育成に資する」とされている。なお、第二次世界大戦末期にも同様の目的を持った「特別科学学級」という制度が存在した。年度ごとの指定校数は以下の通り。2014年（平成26年）度現在204校が指定されている。指定校の選考においては研究内容・方法、研究計画、研究体制、評価方法・計画等が整っているかを中心に企画評価協力者（学識経験者等）が審査し、地域バランス等も考慮して行われている。国立天文台普及室長の縣秀彦はSSH指定校からすばる望遠鏡の見学要請を受けた際、望遠鏡のあるハワイ島のマウナ・ケア山（標高4205m）は16歳未満の登頂が禁止されている山であるにもかかわらず一部の高校の連絡や準備が不十分であったという経験を引いてSSHの教育活動に「科学技術系人材の育成」という本来の目的だけではなく、「学校の面目や先生の個人的な動機」が介在していると事業に疑問を呈した。またSSHは指定された一部の高校に予算を集中させる制度であるため、教育の機会均等の観点から好ましくなく「SSHの隣の高校にも理科好きの生徒はいるのですから」と予算を全国の科学館や博物館の充実に向けたほうがよいと指摘した。指定期間は2002年（平成14年）度 - 2004年（平成16年）度までの3年間で、既に終了済み。現在、山形県立米沢興譲館高等学校と新潟県立長岡高等学校以外の高等学校は2005年（平成17年）度に新規指定もしくは終了経過措置校に指定されている。指定期間は2003年（平成15年）度 - 2005年（平成17年）度までの3年間で、既に終了済み。なお、山口県立岩国高等学校と三重県立四日市高等学校以外の高等学校は2006年（平成18年）度に新規指定もしくは終了経過措置校に指定されている。指定期間は2004年（平成16年）度 - 2006年（平成18年）度までの3年間で、既に終了済み。なお、山口県立山口高等学校以外の高等学校は2007年（平成19年）度に新規指定もしくは終了経過措置校に指定されている。指定期間は2005年（平成17年）度 - 2009年（平成21年）度までの5年間で、既に終了済み（2002年（平成14年）度指定校の新規指定も含む）。終了経過措置期間は2005年（平成17年）度、2006年（平成18年）度の2年間で、既に終了済み。なお、筑波大学附属駒場中学校・高等学校、愛知県立岡崎高等学校、高知県立高知小津高等学校、西大和学園高等学校は2007年（平成19年）度に、岡山県立岡山一宮高等学校は2009年（平成21年）度に新規指定されている。指定期間は2006年（平成18年）度 - 2010年（平成22年）度の5年間で、既に終了済み（2003年（平成15年）度指定校の新規指定を含む）。終了経過措置期間は2006年（平成18年）度、2007年（平成19年）度の2年間で、既に終了済み。なお、広島大学附属高等学校は1年の終了経過措置を経て、2007年（平成19年）度に新規指定されている。また、秋田県立大館鳳鳴高等学校、新潟県立新潟南高等学校、福井県立高志高等学校、愛知県立一宮高等学校は2008年（平成20年）度に新規指定されている。指定期間は2007年（平成19年）度 - 2011年（平成23年）度まで（2002年（平成14年）度 - 2004年（平成16年）度指定校の新規指定を含む）。終了経過措置期間は2007年（平成19年）度、2008年（平成20年）度の2年間で、既に終了済み。なお、兵庫県立神戸高等学校は2008年（平成20年）度に、福井県立藤島高等学校は2009年（平成21年）度に新規指定されている。指定期間は2008年（平成20年）度 - 2012年（平成24年）度まで（2003年（平成15年）度 - 2004年（平成16年）度指定校の新規指定を含む）。指定期間は2009年（平成21年）度 - 2013年（平成25年）度まで（2002年（平成14年）度・2004年（平成16年）度指定校の新規指定を含む）。指定期間は2010年（平成22年）度 - 2014年（平成26年）度まで（2005年（平成17年）度指定校の新規指定を含む）。指定期間は2011年（平成23年）度 - 2015年（平成27年）度まで。＊…過去にも指定を受けている学校※…平成18年度指定で、平成23年度新規指定に採択された学校指定期間は2012年（平成24年）度 - 2016年（平成28年）度まで。＊…過去にも指定を受けている学校※…平成19年度指定で、平成24年度新規指定に採択された学校

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