第18回目となる1988年のカンピオナート・ブラジレイロ・セリエAは、IIコパ・ウニオン (II Copa União) の大会名で1988年9月2日から1989年2月19日にかけて行われ、バイーアが優勝した。得点王はインテルナシオナルのニウソン（15ゴール）だった。前年の1987年度は、1部リーグの参加チーム拡大路線を推し進めるブラジルサッカー連盟 (CBF) に、主力13クラブが反対したため、1部リーグが主力13クラブを中心とした16チームによる「コパ・ウニオン」と、CBF主催の16チームによる「カンピオナート・ブラジレイロ・イエローモジュール」に分かれる異常事態（双方の優勝チームによる統一王座決定戦もなかった）となったが、その後双方が歩み寄り、この年からチーム数を段階的に制限・削減する形で、1部が一つのリーグに再統一された。その最初のシーズンである。勝利には勝点3、引き分けの場合はPK方式で勝敗を決し、PK勝ちには勝点2、PK負けには勝点1を獲得する。第2ステージで最終フェーズ進出圏内に入ったヴァスコ・ダ・ガマは、第1ステージで既に最終フェーズ進出を決めているため、それ以外のチームの中で総合成績が最も良いバイーアも最終フェーズに進出。 バイーアが優勝。

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