第16回Jリーグユース選手権大会は、Jリーグユース選手権大会の2008年度の大会である。予選リーグは7月13日から11月24日まで、決勝トーナメントは12月7日から12月27日まで開催されガンバ大阪ユースが6年ぶり4度目の優勝を果たした。7月13日から11月24日にかけてJ1、J2の31クラブ（FC岐阜、ロアッソ熊本は不参加）を、前年度の主要大会の成績を基に算出したポイントによって7グループに分け、ホーム・アンド・アウェー方式による2回戦い総当たりによるリーグ戦を行った。各予選リーグを通過した14チームと、日本クラブユースサッカー連盟加盟の代表4チームを合わせて18チームで行った。

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