閉鎖都市（へいさとし）、または秘密都市（ひみつとし）とは、旅行や居住が制限されていた（いる）都市である。かつてのソビエト連邦や現在のCIS諸国における閉鎖都市が代表的である。ソビエト連邦の閉鎖都市には、大きく分けて2つのカテゴリーがあった。ソビエト連邦は第二次大戦後の1940年代後半より、核開発などのための特別な都市を秘密裏に建設し始め、さらに軍事上重要な都市への旅行を制限し始めた。外国人のみならず、場合によっては自国民や地元住民も、閉鎖都市には旅行出来ず、住所も他人に言えなかった。例えば、カリーニングラード州全体が、外国人のみならず、居住者ではないソビエト住民に対しても旅行が制限されていた。セヴァストポリとウラジオストクも海軍基地があったため、同様に国内旅行も制限されていた。軍需産業が集積するゴーリキー（現ニジニ・ノヴゴロド）、戦車生産の中心であるペルミ、ミサイル・ロケット開発の中心であるクイビシェフ（現サマーラ）といった大都市も閉鎖都市とされていた。アンドレイ・サハロフの流刑先としてゴーリキーが選ばれたのは、外国人特派員が接触できないようにするためだった。閉鎖都市には、ソビエト連邦によって建設された秘密都市「'（zakrytye administrativno-territorial'nye obrazovanija、略称 ' /ZATO; 閉鎖行政地域組織）」が含まれている。これらは学術目的・科学研究目的（主に、核兵器開発・製造やミサイル・宇宙開発のためのもの）で建設され、永らく地図にも載らず、正式な地名ではなく暗号名（近隣大都市の名の後ろに数字が振られる）で呼ばれていた。ロシア連邦における閉鎖都市（ZATO）の数は公式には知られていないが、大体200万人の住民がいると見積もられている。閉鎖都市の多くはソ連崩壊後開放されたが、ZATOはソ連崩壊後の現在も特別な行政組織になっており居住者や関係者以外の立ち入りは規制されている。現在42のZATOが知られ、さらに約15の確認されない都市があると考えられている。ロシア原子力エネルギー省の命令で今日に至るまでまだ閉鎖されている都市は、核開発にかかわるZATOが多く、スヴェルドロフスク州のレスノイ市（Lesnoy）とノヴォウラリスク市（Novouralsk）、チェリャビンスク州のオジョルスク市（Ozyorsk）、スネジンスク市（Snezhinsk）とトリョフゴールヌイ市（Tryokhgorny）、ニジニ・ノヴゴロド州のサロフ市（Sarov）、トムスク州のセーヴェルスク市（Seversk）、ペンザ州のザレーチヌイ市（Zarechny）、クラスノヤルスク地方のゼレノゴルスク市（Zelenogorsk）とジェレズノゴルスク市（Zheleznogorsk）などがある。宇宙開発関係ではアムール州のツィオルコフスキーなどがある。ロシア国防省は、30から90の町や市を閉鎖しているといわれるが、公式なリストは機密である。閉鎖都市のいくつかは外資の投資のためには開かれるが、外国人の旅行は許可が無ければ出来ない。例としては、核技術流出阻止のためにアメリカ合衆国エネルギー省国家核安全保障局（NNSA）とロシア原子力エネルギー省がサロフ市、スネジンスク市、ジェレズノゴルスク市で共同で行う「核開発都市イニシアティヴ（the Nuclear Cities Initiative (NCI)）」などである。閉鎖都市の数は、1990年代半ば以降急速に減少している。しかし、2001年10月30日より、北方の都市、ノリリスク（Norilsk）、タルナク（Talnakh）、カイエルカン（Kaierkan）、ドゥディンカ（Dudinka）、イガルカ（Igarka）への外国人の旅行が規制された。これらの都市に旅行しようとするロシア人も旅行許可が必要となった。カザフスタンでは、ロシア連邦の管理する2つの閉鎖都市が存在する。バイコヌール宇宙基地のあるバイコヌール（旧レニンスク）と、セミパラチンスク核実験場のあるクルチャトフである。ウクライナでは、黒海艦隊の基地があるセヴァストポリや、ミサイルの製造拠点であるドニプロペトロウシクが1990年代半ばまで閉鎖されていた。このほか、1970年には当時のソ連によってチェルノブイリ原子力発電所や、その従業員の居住地として建設されたチェルノブイリやプリピャチも閉鎖都市であったが、1986年のチェルノブイリ原子力発電所事故により、プリピャチに許容量を大幅に超える放射能が降り注ぎ、住民は全員避難させられ街は放棄された。エストニアでは、近年までシッラマエ、パルティスキの2つの閉鎖都市が存在していた。シッラマエにはかつてソビエト連邦の原子力発電所や核兵器施設用に燃料棒や核物質を製造する化学工場があり、1991年にエストニアが再独立するまで閉鎖都市であった。パルティスキにはソビエト海軍原子力潜水艦訓練センターがあり、1994年にロシア海軍が撤収するまで閉鎖都市となっていた。スウェーデンでは、近年までゴットランド島を中心としたゴットランド県では、一般人の立入りが制限されていた。ゴットランドでは中世以来、要塞であり、冷戦期は軍事基地であった。スウェーデンは東西冷戦では中立の立場であったが、潜在的に親西側であり、基地のあったゴットランド島は東側との最前線の場所に位置していた。アメリカ合衆国でも、特に核兵器に関して同様の機密都市を建設する事がある。マンハッタン計画による原子爆弾研究・製造の拠点として、1943年にオーク・リッジ、ロスアラモス、ハンフォードの3つの都市を建設している。いずれも都市の建設前は大規模な人口密集地は存在していない。オーク・リッジとロスアラモスは、該当地区とその周囲に農村地帯が点在しているだけだった。その居住していた農民たちから、アメリカ陸軍が半ば強制的に土地を収用し、最終的に応じないものは強制排除した。オーク・リッジやロスアラモスと言った現在の地名は、付近に過去に存在した地名から命名された。ハンフォードはそれ以前から同名の漁村が存在していたが、やはり政府によって強制的に土地を収用され立ち退かされている。建設当初はソ連同様正式な地名としての都市名は存在しておらず、オーク・リッジはサイトX、ロスアラモスはサイトY、ハンフォードはサイトWと施設名で呼称された。また個々の施設もその目的や用途、機能を隠匿するため、S-25、Y-12といったコードネームで呼ばれた。しかしこうした秘匿名称を使うことは返って周囲の興味を引くという考え方から、土地収用前に存在した地名や、近隣に存在した地名などをあてがった。しかし地図にそれらの施設が記載されることはなく、実際にそのような都市・施設が存在しているかどうかは、一般市民はもとより政府・軍関係者でも一部のものしか知らない事実だった。ソ連との最大の違いは、民間の大企業が関連していることである。当初こそクリントン・エンジニア・ワークスと呼ばれる、そのものが目的である偽装会社が設立されたが、資本主義経済のアメリカではプロジェクトが大規模になるにつれて施設建設や資材・部品の供給などに民間資本の参加を必要とし、元々軍需産業を手掛けていたゼネラル・エレクトリックや、ウェスティングハウスと言った企業が参加するようになった。「マンハッタン計画」が終了した1947年以降、オーク・リッジとロスアラモスは存在自体の秘匿対象から外れ、正式な地名・自治体として公表された。しかし、依然として施設の内容などは秘匿された。また住民の管理も続き、さながらソ連型社会を思わせるかのような居住統制が行われていた。また人種差別も敢えて強まるように指導され、1950年代から1960年代にかけて強い反対運動が展開された。これらの都市が完全に解放されるのは、冷戦の終結を待つことになる。一方、核燃料や核廃棄物の再処理施設として建設されたハンフォードは、ハンフォード・サイトと呼ばれ、現在も核施設の労働者以外は基本的に居住せず、外国人の立ち入りも制限されている。核燃料の冷却などに使われた低レベル放射性廃棄物に相当する廃液はコロンビア川に放流されていた。また高レベルの放射性廃液を貯蔵するタンクが建設され、後に地中に埋められたが、老朽化により漏れ出し、地下水や土壌を汚染している。この問題について、連邦政府は1988年から浄化計画を進行させているが、順調とは言い難い。核兵器開発の目的で造られた都市第9学会（青海省海北チベット族自治州）。「北西核兵器研究設計学会」「211工場」とも呼ばれる。また大連市の旅順口区は人民解放軍海軍の基地があることから2009年まで全域が制限区域とされていたが、現在は軍港周辺など一部を除き開放され、外国人の旅行ができるようになった。戦時下の毒ガス開発の島として、瀬戸内海の島で広島県に属する大久野島が、戦前は地図から消されていた。

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