本巣郡（もとすぐん）は、岐阜県（美濃国）の郡。以下の1町を含む。1879年（明治12年）に行政区画として発足した当時の郡域は、以下の区域にあたる。1897年（明治30年）に行政区画として発足した当時の郡域は、以下の区域にあたる。8世紀頃の戸籍には御野国本簀郡との記載がある。本巣郡には美濃郷、鹿立郷、遠市郷、安堵郷、穂積郷、物部郷、船木郷、粟田郷の8郷があった。

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