GROMACS（グローマックス、Groningen Machine for Chemical Simulations、グローニンゲン・マシン・フォー・ケミカル・シミュレーションズ）は、フローニンゲン大学で開発された分子動力学シミュレーションのソフトウェアパッケージである。フリーソフトウェアであり、GNU GPLライセンスに基づいて自由に改変することができる。地球上で最速の分子動力学ソフトウェアを目指しており、並列計算を前提としたプログラミングがなされている。プログラムの大部分はC言語で記述されており、同じグループが以前に開発したGROMOS（FORTRAN 77ベース）が参考にされている。バージョン4.6時点に於いて、SSEやAVX、HPC-ACEなどの拡張命令を用いたアセンブリ言語のルーチンが実装されており、高速な計算が可能となっている。力場はGROMACS、GROMOS、OPLS-AA、AMBER、CHARMMが標準で使用可能である。GROMACSプロジェクトは1991年にオランダ、フローニンゲン大学生物物理化学科で始まった（1991年-2000年）。2001年からは、スウェーデンの王立工科大学とウプサラ大学のGROMACS開発チームによって開発されている。GROMACSはアルゴリズム的ならびにプロセッサ特異的最適化によって極めて速く、大抵は多くのシミュレーションプログラムよりも3から10倍高速に動作する。GORMACSはコマンドラインを通じて操作され、インプットおよびアウトプットにファイルを用いることができる。GROMACSは計算の進行度合いと完了予定時刻のフィードバック、トラクジェクトリビュアー、トラクジェクトリ解析のための豊富なライブラリを備える。加えて、異なる力場のサポートによってGROMACSは非常に柔軟性が高い。MPIあるいはスレッドを用いて並列計算が可能である。

出典:wikipedia