石垣港（いしがきこう）は、沖縄県石垣市にある重要港湾。港湾管理者は石垣市。日本最南端の重要港湾であり、八重山列島の人や物の交流の中心となっている。沖縄県内や日本各地からの八重山列島への物資集散地としての役割や、行き来する旅客の拠点としての役割を果たしている。また、互いに国交のない中華人民共和国と台湾（中華民国）との貿易の際の一時寄港目的での利用（クリアランス船）も行われている。ただし、増加していたクリアランス船的の利用は、三通政策の変化により減少に転じている。石垣島のほぼ南端にある港であり、石垣市役所、竹富町役場、総合病院など主要施設のほか、石垣市の繁華街とも近い。かつては琉球海運による国鉄小荷物連絡輸送（チッキ）のために石垣港駅が設けられていた。石垣港は、以下の地区からなる。航路については、旅客営業を行う定期航路のみ記載（休廃止された航路は就航最終時点の情報を記載）。

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