大深山遺跡（おおみやまいせき）は、長野県南佐久郡川上村大字大深山にある縄文時代中期の集落跡。1966年（昭和41年）国の史跡に指定された。天狗山の南麓、赤顔山（あかづらやま）の東南麓、千曲川右岸の南向きの標高1300mを越える平坦地に位置している。八ヶ岳山麓一帯に数多く分布する縄文遺跡の中でも最高度を誇り、日本各地の縄文遺跡中最も標高の高い遺跡の一つとされる。1953年（昭和28年）の林道開発における再発見以来、大深山観光協会や村教育委員会の手で発掘調査が行われ、これまでに8次にわたる調査で竪穴住居跡が50箇所（中期中葉が25、中期後半が19、不明が7）、積石遺構、数万点に及ぶ土器、石器が出土しており、住居跡には2棟の住居が復元されている。完全な形で出土した人面香炉型土器（通称『ウルトラマン』）などの出土品は、川上村文化センターに保存展示されている。

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