第9回日本フットボールリーグは2007年3月18日から同12月2日まで行われた日本フットボールリーグ（JFL）のリーグ戦である。優勝は佐川急便SCであった。第9回JFLの参加クラブは以下の通りである。このうちTDK SC、FC岐阜が前シーズンの全国地域リーグ決勝大会からの昇格クラブである。SC鳥取が組織変更し、ガイナーレ鳥取になった。また、ジェフ・クラブが名称を変更し、佐川急便東京SCと佐川急便大阪SCが合併した（チーム名称は佐川急便SC）。前期終了時の上位1チームに第87回天皇杯の出場権が与えられる。各試合において勝利チームに勝利チーム賞8万円を支払う。準加盟クラブのJリーグ加盟について12月3日のJリーグ臨時理事会で審議が行われ、2位のロッソ熊本と3位のFC岐阜のJリーグ加盟が正式に承認された。9月10日にアローズ北陸とYKK APの合併の報道が正式リリースされ、次年度より「カターレ富山」としてJFLに参加することとなった。2チームのJリーグ加盟のほかに合併により1チーム減少したため、JFLと地域リーグ間の昇降格のレギュレーションが以下のように変更された。レギュレーション変更により、全国地域リーグ決勝大会1位のファジアーノ岡山FC、2位のニューウェーブ北九州、3位のFC Mi-O びわこKusatsuがJFLへ自動昇格した。

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