大分家庭裁判所の本庁は大分地方裁判所の本庁に、大分家庭裁判所の支部は大分地方裁判所の支部に併設されている。また、本庁・支部・出張所のいずれにも簡易裁判所が併設されている。※ただし、杵築・佐伯・竹田の各支部の合議事件・少年事件は本庁で、日田支部管内の合議事件・少年事件は中津支部でそれぞれ取り扱う。※豊後高田出張所は家事事件の受付および出張家事審判・出張家事調停のみ行い、その他の事務は中津支部が扱う。大分家庭裁判所の所長は大分地方裁判所の所長を兼任している。大分地方裁判所#歴代所長を参照。

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