名誉所長（めいよしょちょう）は栄誉職または称号。国の栄誉称号または民間における名誉称号の一種。類似称号として名誉総長と名誉センター長がある。内閣府経済社会総合研究所における役職の一つ。2014年(平成25年)には清家篤がその任に就いている。国立の医療機関では、昭和39年(1964年)に厚生省令として制定された国立高度専門医療センター名誉総長等の称号の授与に関する省令に基づき、厚生大臣に国立高度専門医療センターに総長、病院長又は研究所長として、国立ハンセン病療養所に所長として多年勤務した者のうち、国立高度専門医療センター又は国立ハンセン病療養所の運営について功績のあったものに対して名誉総長或いは名誉院長、名誉所長の称号を贈ることができるとしている。今日では、厚生省の厚生労働省への移行に伴い、随時改正され、平成16年3月31日厚生労働省令第77号として厚生労働大臣により授与されることとなっている。岐阜県では県の所管する施設で勤務し功績ある者に対し名誉所長の称号を贈るほか、千葉県では、千葉県救急医療センター、千葉県がんセンター、千葉県精神科医療センターにおいて、功労顕著なセンター長経験者に対して名誉センター長の称号を授与している。山梨県南アルプス市高度農業情報センターでは名誉所長の職が置くことができるとしている。その他、名古屋市総合リハビリテーションセンターなどに名誉センター長が置かれている。国内外を問わず大学においては、学内に設置する研究所・センターなどにおいて名誉職としての所長として名誉所長を置くことがある。

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