南水元（みなみみずもと）は、東京都葛飾区の地名。現行行政地名として南水元一丁目から四丁目が置かれている。郵便番号は125-0035。葛飾区の北部、水元地域の南部に位置する。北で水元一丁目・三丁目、北東で東水元一丁目・三丁目、南西で東金町二丁目、南で新宿六丁目、西で中川を挟んで対岸に足立区中川と接する。。町域は東京都道307号王子金町江戸川線で北辺を画し、町域内は直線状の道路が格子状に整備された町並みが見られる。地区の西辺を南北に流れる中川には飯塚橋が架かり、対岸の足立区中川・大谷田と連絡している。住宅地の地価は、2014年（平成26年）1月1日の公示地価によれば、南水元4-23-4の地点で24万1000円/mとなっている。旧来の「水元村」に由来。

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