天草キリシタン館（あまくさキリシタンかん）は、熊本県天草市にある市立の文化施設。1966年（昭和41年）に開設した天草切支丹の歴史資料を展示する資料館（天草切支丹館）。キリスト教の伝来、南蛮文化、迫害、天草・島原の乱、隠れキリシタン、乱後の代官行政、というテーマで構成し、それぞれの背景や歴史を紹介している。2010年（平成22年）7月1日に名称を「天草キリシタン館」に変更しリニューアルオープンした。

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