伊号第四十六潜水艦（いごうだいよんじゅうろくせんすいかん、旧字体：伊號第四十六潜水艦）は、大日本帝国海軍の潜水艦。伊十六型潜水艦（巡潜丙型）の6番艦。1941年（昭和16年）の昭和17年度計画（マル急計画）により、佐世保海軍工廠で1942年（昭和17年）11月21日起工、1943年（昭和18年）5月25日に艦艇類別等級別表に加えられ、6月3日進水、1944年（昭和19年）2月29日に竣工した。横須賀鎮守府籍となり、訓練部隊の第六艦隊第11潜水戦隊に編入されて訓練に従事。5月7日、不良箇所が発見され修理を受ける。5月30日に第15潜水隊に編入。10月19日、伊46は呉を出撃し、フィリピンレイテ島東方沖合に進出する。26日、敵輸送船団を発見したとの報告を最後に消息不明。11月19日に帰投予定だったが、帰ってこなかった。アメリカ側記録によると、10月28日にフィリピン方面で米護衛駆逐艦「」の攻撃を受け戦没。艦長の山口幸三郎少佐以下乗員112名全員戦死。沈没地点はフィリピン東方沖合、。同年12月2日喪失認定、1945年（昭和20年）3月10日除籍。

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