ジョン・エドワード・アールクィスト（Jon Edward Ahlquist）は分子系統学と鳥類学の専門家、主にイェール大学でチャールズ・シブリーと長く共同研究を行った。1987年、アールクィストはシブリーと共にイェールを去った。1988年、アールクィストとシブリーは全米科学アカデミーからダニエル・G・エリオットメダルを受賞する。1991年1月（しばしば1990年ともされる）、チャールズ・シブリーとアールクィストは"Phylogenetics and Classification of Birds"を発表。これはDNA-DNAハイブリダイゼーションによる、鳥類の新しい系統学（シブリー＝アールクィスト鳥類分類）を示したものだった。このときアールクィストはオハイオ大学の動物学准教授であった。1999年に引退(Ahlquist, 1999)。

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