ボホール海峡（）は、フィリピン中部ヴィサヤ諸島のボホール島とセブ島との間にある海峡で、セブ海峡 () ともいう。ミンダナオ海（ボホール海）とカモテス海とを結んでいる。海峡内には主にマクタン島、パングラオ島が浮かぶ。沿岸にはセブを中核としたフィリピン第2の都市圏、メトロ・セブがある。

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