熊本家庭裁判所の支部は熊本地方裁判所支部に併設されている。また、支部・出張所には簡易裁判所が併設されている。※ただし、各支部の合議事件、玉名・山鹿・阿蘇の各支部の少年事件は本庁で、人吉支部管内の少年事件は八代支部でそれぞれ取り扱う。※高森、水俣、牛深の各出張所は、家事審判法で定める家庭に関する事件の審判及び調停のみ扱い、その他の事務は当該支部が扱う。※御船出張所は家事事件の受付および出張家事審判・出張家事調停のみ行い、その他の事務は本庁が扱う。任期の後ろは後職

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