東京フリーメソジスト教会（とうきょうフリーメソジストきょうかい）は、日本のプロテスタント系メソジスト派の団体の1つ。日本福音同盟に加盟している。戦後、米国フリー・メソジスト引退牧師夫人のエバ・B.ミリカンが来日して宣教を開始する。最初は日本のフリーメソジストを助けるつもりであったが、事情があって自宅を開放して集会を開き、集まった高校生を中心として教会を建てる。信仰と規範と実践において一致できなくなり、フリーメソジストの信仰を守るために単立教会になる。日本フリーメソジスト教団との合流も議論されたが、2000年に合流案が廃案となり、立ち消えとなっている。

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