抗酸染色（こうさんせんしょく、acid-fast staining）とはマイコバクテリウム属菌やノカルジア（"）の一部の菌などの染色に用いられる染色法である。この方法によって染色される細菌のことを、抗酸菌(acid-fast bacteria)と総称する。抗酸性染色（こうさんせいせんしょく）、抗酸菌染色（こうさんきんせんしょく）とも呼ばれる。マイコバクテリウム属やノカルジアの一部の菌は、グラム染色などの通常の染色では多量の脂肪酸の存在のために難染性を示すが、強力に染色された後は、酸やアルコール処理による脱色が起こりにくくなる（酸による脱色への抵抗性、acid-fastness）。この性質を利用した染色法であり、石炭酸フクシンにより染色後、塩酸アルコールによって処理するチール・ネールゼン法（）が代表的であり、陽性では赤色、陰性では青色に染まる。特に、病原性の抗酸菌である結核菌やらい菌を観察する方法の一つとして重要である。結核患者の喀痰を抗酸染色して、その中に含まれている結核菌の数を計測して求めるガフキー号数は、結核の病状の度合いや患者からの伝染性を知るための指標の一つとして用いられる。鹿江雅光、新城敏晴、高橋英司、田淵清、原澤亮編　『最新家畜微生物学』　朝倉書店　1998年　ISBN 4254460198

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