21世紀COEプログラム（にじゅういっせいきしーおーいープログラム、"The 21st Century Center Of Excellence Program"）は、「大学の構造改革の方針」（2001年6月）に基づき、2002年から新たに開始された文部科学省の研究拠点形成等補助金事業である。日本の大学に世界最高水準の研究教育拠点を形成し、研究水準の向上と世界をリードする創造的な人材育成を図るため、重点的な支援を行うことを通じて、国際競争力のある個性輝く大学づくりを推進することを目的としている。日本学術振興会に設置された21世紀COEプログラム委員会での審査によって、補助金交付先の審査・評価がなされる。補助金額自体は大きくないが、採択されるか否かが研究機関としてのイメージなどに大きな影響があり、各大学は採択に向けて大きな力を割いている。なお、後継の制度としてグローバルCOEプログラムが実施されている。以下は、第1回に限り追加的に募集された「革新的な学術分野」を含め、2002年度から2004年度まで（第1回）の採択された研究を行っている大学の一覧である。結果的に、科学研究費補助金の上位機関において、配分額上位を占める旧帝国大学7校に、東京工業大学、慶應義塾大学、早稲田大学が割って入る形になった。また、私立大学も含め、特色のある研究を行っている採択拠点の大学も数多く、今後の大学の研究活動の活発化が期待される。採択件数上位11機関の採択件数および補助金交付額は次の通り。21世紀COEは採択の2年後に文部科学省による中間評価が行われる。2002年度および2003年度の採択拠点の結果を以下にまとめる（現在一部大学のみ記載）。

出典:wikipedia