医薬品における殺菌剤（さっきんざい、）とは、病原性を有する微生物を殺す、または増殖を抑止するための薬剤。殺菌薬とも。ただし、抗生物質や抗真菌薬を除外し、微生物を非選択的に殺すものを呼ぶのが普通である。また医療機器の殺菌のみ、あるいは外用（皮膚）にのみ用いるものは消毒薬ということが多い。例として以下のようなものがある。

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