UEFA EURO 2000の予選は、1998年から1999年にかけて行われた。予選ラウンドでは、参加した49カ国は抽選によって9組に分けられ、それぞれホームアンドアウェー方式の総当たり戦を行う。そして各組の1位9カ国と、各組2位の9カ国の中で最も成績のよい1カ国（ベスト・ランナーアップ）の、計10カ国が自動的に本大会への出場権を獲得する。さらに、各組2位の残り8カ国がホームアンドアウェー方式のプレーオフを行い、本大会に出場する4カ国を決める。これに開催国であるベルギーとオランダを加えた、計16カ国が本大会で対戦する。各組2位の国の中で最も成績のよい1カ国（ベスト・ランナーアップ）は、自動的に本大会への出場権を獲得する。ベスト・ランナーアップとは、各組の上位4カ国の対戦成績による勝ち点と得失点差で最も成績のよい1カ国を意味する。それ以外の国は、プレーオフで出場権を争う。UEFA EURO 2000の予選ラウンドのベスト・ランナーアップはポルトガルである。ベスト・ランナーアップではない各組2位の8カ国は抽選によって4組に分けられ、それぞれホームアンドアウェー方式のプレーオフを行う。そして各組の成績上位4カ国が本大会への出場権を獲得する。

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