第49回全日本大学サッカー選手権大会は2000年11月11日から11月19日にかけて開催された全日本大学サッカー選手権大会である。中京大学が初優勝を果たした。9地域の代表15校と総理大臣杯全日本大学サッカートーナメント優勝校が参加した。今大会では中京大学が、関東・関西勢以外からは初の優勝となった。

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