特別科学学級(とくべつかがくがっきゅう)とは、第二次世界大戦末期、日本を支える優秀な科学者や技術者の育成を目的として設けられた英才学級のことである。全国から選抜された児童・生徒が高度なエリート教育を受け、結果的に敗戦後の高度経済成長を牽引する人材として、理工系をはじめ各界で活躍した。「特別科学教育学級」、「特別科学教育班」、「特別科学組」とも呼ぶ。1944年9月9日、衆議院議員永井柳太郎によって「戦時穎才教育機関設置に関する建議案」が衆議院に建議され、同年9月11日に可決。同年12月26日、文部省は、「科学に関し高度の天分を有する学徒に対し特別なる科学教育を施し我国科学技術の飛躍的向上を図らんが為之が実施に関する方途を研究せんとす」として、に特別科学教育班を設置。全国各地の国民学校の4〜6年生および旧制中学校の1〜3年生の中から物理学・化学・生物学・数学に秀でた児童・生徒を選抜し、上記各高師・女高師の附属小中学校（金沢高師のみ当時附属校が存在しなかったため近隣の小中学校）、にて1945年1月から授業を開始した。さらに同年4月からは湯川秀樹や駒井卓たちの意向により、京都帝国大学にも特別科学教育班が設置された。京都帝国大学には附属校が存在しなかったので、に特別科学学級が設置され、こちらは同年5月22日から授業が始まった。各学年の定員は30名だった。授業の内容は数学や物理学や化学はいうに及ばず、当時敵性語だった英語、さらには国語・漢文・歴史にもわたっており、その程度は「旧制高校第2学年修了迄の全教育内容を、旧制中学第4学年卒業（旧制中学は本来5年制）までに理解把握させる」ものであり、例えば数学では、中学1年で関数、対数、3年で導関数、積分、微分方程式を学ばせた。特別科学学級では、各高等師範学校や帝国大学の教官がじきじきに旧制高等学校（現在の四年制大学教養課程）レベルの授業をおこない、物理・化学の実験や、生物の実習などにも重点が置かれた。経済学者の佐和隆光によると、ある京都大学名誉教授は湯川から直接物理学を教わったと証言している。当時、禁書とされていた津田左右吉の『古事記及び日本書紀の新研究』を題材に用いるなど、当時の軍国主義的イデオロギーにとらわれない高度な内容の授業で進み方も速かった。さらに、特別科学学級の児童・生徒は学徒動員が免除され、学習を継続しうる特権を持つとともに、上級学校への進学が保証された。第二次世界大戦で日本が敗北してから「差別的で民主主義に反する」との批判を受けて1946年11月に廃止が決定され、1947年3月31日をもって特別科学学級は終了となった。しかし、特別科学学級の出身者は、戦後の高度経済成長を牽引するエリートとして、理工系だけでなく各界で活躍した。また、現在のスーパーサイエンスハイスクール（SSH）構想に特別科学学級の精神が受け継がれているとみる向きは多い。卒業生の多くは東京大学に進んだ。たとえば東京高等師範学校附属中学校（現・筑波大学附属中学校・高等学校）の場合、といった具合であった。佐和隆光は映画監督の伊丹十三と共に小説家の筒井康隆を特別科学学級出身者に挙げているが、筒井当人は自分が学んでいたのは政府設置の特別科学学級ではなく大阪市設置の特別教室だったと述べている。卒業者の結束は固く、第二次世界大戦後もしばしば同窓会をおこなっている。

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