設置者は学校法人綜藝種智院で、人文学部の中に仏教学科と社会福祉学科を持つ大学である。真言宗系の大学で、古義真言宗の仁和寺、宝山寺、朝護孫子寺、勧修寺、大覚寺、醍醐寺、中山寺、西大寺、教王護国寺（東寺）、清澄寺、泉涌寺、善通寺、須磨寺および随心院の14本山が経営に参画し、真言宗智山派、真言宗豊山派および新義真言宗の3派が教育振興に協力している。大学名は空海（弘法大師）が828年（天長5年）に開いた教育機関である綜芸種智院に因む。2011年（平成23年）4月、学校法人真言宗京都学園が運営していた洛南高等学校・附属中学校は学校法人真言宗洛南学園に経営が移管され、また法人名称が学校法人綜藝種智院に改称された。さらに、経営支援本山として、石山寺、国分寺、七宝瀧寺、神護寺、平間寺、前神寺、室生寺が加わった。仏教学科では真言密教を中心とした仏教学を学ぶ。社会福祉学科では社会福祉士、精神保健福祉士の国家試験受験資格を卒業と同時に取得することができる。（総黌総理）（真言宗事相講伝所総理）（私立古義真言宗聯合高等中学校）（真言宗京都大学総理）（真言宗京都専門学校）（種智院大学）

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