大阪大学医学部や神戸大学医学部出身の教授が多い。6年間の学費は3700万円程度。兵庫医科大学は、兵庫県で医学部を擁する唯一の私立大学であり、1972年当地にあった武庫川病院を経営する精神科医森村茂樹が中心となって設立された医科単科大学である。古くから兵庫県の特別推薦入学制度がある。この制度は僻地の医師確保を目的とするもので、これによって入学した者には県から修学資金が貸与され、医師免許を取得後、県が指定する僻地医療機関に貸与期間の1.5倍にあたる期間勤務することで、返還が免除される。創立当初は毎年5名、その後1名の期間を経て現在毎年5名を養成している。醫聖祭と称し、毎年創立記念日（11月22日）前後に行われている。

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