妙正寺川（みょうしょうじがわ）は、東京都を流れる一級河川。荒川水系の支流である。流路延長9.7km。流域面積21.4km²。東京都杉並区の妙正寺公園内妙正寺池（すぐそばにある妙正寺に由来）に源を発し、途中中野区松が丘二丁目で江古田川を合わせ、新宿区下落合一丁目の辰巳橋付近で神田川高田馬場分水路に合流する。かつては、西武新宿線下落合駅の東側で流路を南に変えて、今の神田川の滝沢橋～落合橋間の地点で神田川と合流していた。だが、大雨の度にこの合流地点は川の水が氾濫したため、高田馬場分水路の建設に合わせて流路を変更し、辰巳橋で神田川高田馬場分水路に合流するよう流路改築が行われ、現在の形になった。この周辺の地名である「落合」とは、この二つの川がかつて合流していたことからその名が付いた。2005年には首都圏を襲った局地的な大雨により、周辺地域で浸水等の被害が発生した。

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