別科（べっか, short-term course）とは、当該種別の学校に入学できる資格を有する者に対して、簡易な程度において、特別の技能教育を施すことを目的とする学校の課程である。サーティフィケート取得を目的とし、修業年限は1年以上で、卒後進路は就職である。学校教育法58条、91条では、高等学校、中等教育学校、特別支援学校、大学、短期大学に設けることができる条文があるが、高等専門学校や専修学校の条項にこの条文はない。学制改革直後、旧制の青年学校本科に相当する課程として、農業、家政の別科が置かれた学校が多かったが、全日制高校の増設や進学率の向上で尽く廃止された。横浜市立横浜商業高等学校には、現在も理容、美容の別科が設置されている。大阪府にある私立高等専修学校であるやしま学園高等専修学校（全日制）は、3年間の高等課程と2年間の別科（専攻科）が設置されており、毎日通いながら合わせて5年間ゆっくりと学ぶこともできるようになっている。高等教育ではなく中等以降高等以前教育に位置づけられ、修了時に学位は発行されない。高等教育に設置されている別科としては、が比較的よく見られる。なお、放送大学等の大学通信教育の選科履修生、科目履修生も別科の一形態と考えることができる。日本の大学では、おもに国立大学に設置されてある留学センターのほかに、留学生用に留学生別科を設置してある大学も多い。設置している大学は以下の通りである。専修学校であるあいち情報専門学校に別科が設けられているが、これはサポート校に近い。

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